吉首大学在多个专业领域都有显著的优势和特色。以下是一些被广泛认为最强的专业：
软件工程：
软件工程不仅入选了首批国家级一流本科专业建设点，还在多个排名中表现优异，如在全国第45位获得B++评级。此外，软件工程的投档线为539分，与临床医学并列排名第一，显示出其高就业前景和发展潜力。
音乐学：
音乐学是吉首大学的国家级特色专业，具有深厚的学术积淀和广泛的行业影响力。
生物科学：
生物科学同样是吉首大学的国家级特色专业，拥有博士点和硕士点，显示出其在科研和学术方面的强大实力。
工商管理：
工商管理专业也是吉首大学的国家级特色专业，入选国家级综合改革试点专业，具有很高的就业率和行业认可度。
体育教育：
体育教育专业入选国家级一流本科专业建设点，体育学为湖南省国内一流建设学科和重点学科，显示出其在体育教育领域的领先地位。
电子信息工程：
电子信息工程专业是湖南省重点学科，培养了大量的电子信息工程人才，就业前景看好。
通信工程：
通信工程专业也是湖南省重点学科，具有较高的教学水平和行业认可度。
统计学：
统计学专业在多个排名中表现优异，投档线为532分，显示出其在数据分析和统计领域的实力。
机械设计制造及其自动化：
该专业在多个排名中均表现出色，投档线为532分，显示出其在机械工程领域的竞争力。
旅游管理：
旅游管理专业是湖南省特色专业，拥有一支高水平的教师队伍和完善实践教学条件，就业前景良好。
综上所述，吉首大学在软件工程、音乐学、生物科学、工商管理、体育教育、电子信息工程、通信工程、统计学、机械设计制造及其自动化、旅游管理等多个专业领域都有显著的优势和特色。这些专业不仅在学术和科研方面表现出色，而且在就业市场上也具有较高的竞争力。建议学生在选择专业时，可以根据自己的兴趣和职业规划，综合考虑这些专业的优势和发展前景。