位于新竹市的大学有以下几所：
台湾交通大学（National Chiao Tung University，简称“台交”或“NCTU”）
台湾艺术大学（National Taiwan University of Arts，简称台艺大）
中华大学（Chung Hua University，简称CHU）
台湾元培科技大学
玄奘大学
国立清华大学（National Cheng Kung University）
国立交通大学（National Central University，简称国立交大）
台湾科技大学新竹校区
私立南华大学
建议：
台湾交通大学和 国立交通大学同根同源，均位于新竹市，且都是顶尖的研究型大学，以理工科著称。
台湾艺术大学是台湾历史最悠久、学科结构最均衡的艺术高等学府。
中华大学和 台湾元培科技大学也是位于新竹市的重要学府，分别成立于1990年和较早时间。
玄奘大学和 私立南华大学也是新竹市内的知名大学。
国立清华大学和 国立交通大学（简称国立交大）历史悠久，以理工科闻名。
台湾科技大学新竹校区以工科为主，是台湾地区重要的科技大学之一。