是的，报考军校时男生需要选择专业。军校专业主要分为指挥类专业和非指挥类专业，以及“合训分流”专业。学生在报考时可以根据自己的兴趣、特长以及未来的职业规划来选择专业。
具体来说，指挥类专业包括中国语言文学、心理学、法学、政治学、信息安全等，非指挥类专业包括物理、机械工程、信息工程等。选择专业时，学生应结合自己的兴趣和特长，选择一个既符合自己兴趣又能为部队做出贡献的专业。
此外，军校招生时男女生都可以选择专业，但具体选择会受到个人兴趣、特长、选科要求以及院校专业设置等因素的影响。一些军校专业可能只招收男生，例如指挥类专业通常要求具备强健的体魄、良好的气质和较强的吃苦精神。
因此，男生在报考军校时需要认真选择专业，以便在未来的军旅生涯中取得更好的成绩和发展。建议学生在报考前详细了解各个专业的特点和要求，结合自己的实际情况做出明智的选择。