杨浦区内的高校中，排名前三的大学分别是 复旦大学、 同济大学和 上海财经大学。其中，复旦大学位于杨浦区，是享誉国内外的著名综合性大学，特别在医学、经济学、管理学等领域具有很高的声誉。同济大学也位于杨浦区，以工程学科著称，培养了大量优秀工程师。上海财经大学则位于杨浦区，是我国金融、会计、管理等经济类学科的重要培养基地。

因此，杨浦五校中排名第一位的是复旦大学，第二位的是同济大学，第三位的是上海财经大学。其他两所学校（华东师范大学和上海理工大学）的排名相对靠后，但也在杨浦区内享有较高的学术声誉。