增城学校垃圾运输的收费标准如下：

自行运至垃圾中转站：

按垃圾实际产出量每吨64元缴纳生活垃圾处理费。

委托环卫部门登门收集并清运：

除了缴纳垃圾清运费每吨31元外，还需支付垃圾处理费，总计95元/吨。

因此，增城学校垃圾运输的费用在 64至95元/吨之间，具体费用根据垃圾类型、运输距离、清运难度等因素而定。建议与当地环卫部门联系，获取更准确的报价。