学校保健室的处罚措施通常依据相关的卫生保健法规和管理条例来执行。具体的处罚方式可能包括：

警告：

对于初次违规且情节较轻的情况，保健室管理人员有权给予警告。

劝阻：

对于违规行为，保健室管理人员可以进行劝阻，以促使相关责任人改正其行为。

限制就诊：

在严重违规的情况下，保健室管理人员有权限制违规师生的就诊资格。

报告相关部门：

对于严重违规行为，保健室管理人员有权向学校相关部门报告，并提出处理建议。

行政处罚：

依据《托儿所幼儿园卫生保健管理办法》，未按要求设立保健室、卫生室或配备卫生保健人员等行为，可能会受到卫生行政部门的警告、责令限期改进等处罚。

经济处罚：

在某些情况下，如供学生使用的文具、娱乐器具、保健用品不符合卫生标准，可能会被没收不符合标准的物品，并处以罚款。

行政处分：

对于情节严重的违规行为，教育行政部门可以给予行政处分，包括警告、罚款等。

其他教育行政处罚：

包括撤销违法举办的学校和其他教育机构、取消颁发学历、学位和其他学业证书的资格等。

建议在处理学校保健室的违规行为时，应确保遵循相关法律法规，并根据具体情节采取适当的处罚措施。同时，应保证处罚过程的公正和透明，维护师生的合法权益。